西湖大学医学院的郭天南教授及其合作者,通过整合来自多家研究机构的努力,成功构建了一幅前所未有的高分辨率、广覆盖人体蛋白质空间分布图。该项目收集了近 3000 份人体组织样本,涵盖了 58 种正常组织类型和 25 种癌症类型,并对超过 1.3 万种蛋白质进行了精确的定量分析。
长期以来,科学界对于蛋白质在人体内的整体空间分布情况缺乏全面的了解。蛋白质作为生命活动的主要执行者,同时也是大多数药物作用的关键靶点,其精确分布信息至关重要。郭天南团队为此开发了一套创新的微量样本蛋白质组分析技术。这项技术能够仅利用芝麻大小的组织样本,实现标准化的蛋白质组学分析,极大地提高了分析速度(约十倍)并降低了成本,为开展大规模、高通量的蛋白质组学研究提供了技术支持。
经过持续的样本收集和实验分析,研究团队建立了一个包含 15332 种蛋白质的数据库。在此基础上,他们对其中的 13609 种蛋白质进行了精密的定量分析,最终绘制出了这张高精细度的人体蛋白质组“地图”。
利用这张新绘制的蛋白质“地图”,研究团队进一步分析了 25 种癌症类型中,肿瘤组织与癌旁正常组织间的蛋白质表达差异。他们共识别出 8940 个在不同组织间存在表达差异的蛋白质。分析结果表明,不同癌症类型在蛋白质表达水平上的变化幅度存在显著差异,其中结肠癌、直肠癌和睾丸癌组织的蛋白质变化最为突出。
此外,研究还发现了 2879 个肿瘤特异性蛋白质,这些蛋白质仅在某些特定的癌症类型中表现出表达变化。
这项重要的研究成果以“Spatial distribution of the proteome in the human body and in cancers”为题,已发表在《自然》期刊上。所有研究数据已通过公开数据库 db.prottalks.com 面向全球研究者开放,以便他们查询蛋白质在 58 种人体组织中的表达丰度,并比较不同癌症类型下的蛋白质变化情况。
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